В стандартной Галерее кроме специально собранных там фото и картинок отображаются и все остальные изображения с устройства - а хотелось бы чтобы там остались только выбранные пользователем медиафайлы. 

В каждой папке, изображения которой не нужны в Галерее можно просто вручную разместить пустой файл с именем .nomedia - и эти папки будут пропускаться при сканировании на наличие медиафайлов.

Второй вариант удобнее - установить и запустить приложение Gallery Excluder. Откроется список всех папок устройства, в котором нужно отметить галочками папки, не нужные в Галерее, и программа автоматически создаст в каждой из них файл .nomedia.

После этого в Галерея будет показывать только нужные медиафайлы. 

Но другим приложениям Android файл .nomedia не помешает видеть все изображения, находящиеся на устройстве.